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perl-bioperl rpm build for : Fedora 7. For other distributions click here.

Name : perl-bioperl
Version : 1.5.2_102	Vendor : Fedora Project
Release : 7.fc7	Date : 2007-04-20 05:38:51
Group : Development/Libraries	Source RPM : perl-bioperl-1.5.2_102-7.fc7.src.rpm
Size : 13.43 MB
Packager : Fedora Project < http://bugzilla_redhat_com/bugzilla>
Summary : A package of Perl tools for computational molecular biology
Description : Bioperl is a package of Perl tools for computational molecular biology.

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Provides :
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::ProteinStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
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perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry)
perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant)
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perl(Bio::PopGen::GenotypeI)
perl(Bio::PopGen::HtSNP)
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perl(Bio::PopGen::IO::csv)
perl(Bio::PopGen::IO::hapmap)
perl(Bio::PopGen::IO::phase)
perl(Bio::PopGen::IO::prettybase)
perl(Bio::PopGen::Individual)
perl(Bio::PopGen::IndividualI)
perl(Bio::PopGen::Marker)
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perl(Bio::PopGen::PopStats)
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perl(Bio::PopGen::PopulationI)
perl(Bio::PopGen::Simulation::Coalescent)
perl(Bio::PopGen::Simulation::GeneticDrift)
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perl(Bio::PopGen::Utilities)
perl(Bio::PrimarySeq)
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perl(Bio::Range)
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perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiCut)
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perl(Bio::Restriction::IO::base)
perl(Bio::Restriction::IO::itype2)
perl(Bio::Restriction::IO::withrefm)
perl(Bio::Root::Exception)
perl(Bio::Root::HTTPget)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::Root::Root)
perl(Bio::Root::RootI)
perl(Bio::Root::Storable)
perl(Bio::Root::Version)
perl(Bio::Search::BlastStatistics)
perl(Bio::Search::BlastUtils)
perl(Bio::Search::DatabaseI)
perl(Bio::Search::GenericDatabase)
perl(Bio::Search::GenericStatistics)
perl(Bio::Search::HSP::BlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::FastaHSP)
perl(Bio::Search::HSP::GenericHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HMMERHSP)
perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)
perl(Bio::Search::HSP::HSPI)
perl(Bio::Search::HSP::HmmpfamHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PSLHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PsiBlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PullHSPI)
perl(Bio::Search::HSP::WABAHSP)
perl(Bio::Search::Hit::BlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::Fasta)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HMMERHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Hit::HmmpfamHit)
perl(Bio::Search::Hit::PsiBlastHit)
perl(Bio::Search::Hit::PullHitI)
perl(Bio::Search::Iteration::GenericIteration)
perl(Bio::Search::Iteration::IterationI)
perl(Bio::Search::Processor)
perl(Bio::Search::Result::BlastResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::HMMERResult)
perl(Bio::Search::Result::HmmpfamResult)
perl(Bio::Search::Result::PullResultI)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::Result::WABAResult)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
perl(Bio::SearchDist)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchWriterI)
perl(Bio::SearchIO::Writer::BSMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::GbrowseGFF)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HitTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::axt)
perl(Bio::SearchIO::blast)
perl(Bio::SearchIO::blasttable)
perl(Bio::SearchIO::blastxml)
perl(Bio::SearchIO::exonerate)
perl(Bio::SearchIO::fasta)
perl(Bio::SearchIO::hmmer)
perl(Bio::SearchIO::hmmer_pull)
perl(Bio::SearchIO::megablast)
perl(Bio::SearchIO::psl)
perl(Bio::SearchIO::sim4)
perl(Bio::SearchIO::waba)
perl(Bio::SearchIO::wise)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::Seq::BaseSeqProcessor)
perl(Bio::Seq::EncodedSeq)
perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)
perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeqI)
perl(Bio::Seq::Meta)
perl(Bio::Seq::Meta::Array)
perl(Bio::Seq::MetaI)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual)
perl(Bio::Seq::PrimedSeq)
perl(Bio::Seq::QualI)
perl(Bio::Seq::Quality)
perl(Bio::Seq::RichSeq)
perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(Bio::Seq::SeqBuilder)
perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
perl(Bio::Seq::SeqWithQuality)
perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
perl(Bio::Seq::TraceI)
perl(Bio::SeqAnalysisParserI)
perl(Bio::SeqFeature::Annotated)
perl(Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor)
perl(Bio::SeqFeature::Collection)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::Computation)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::NC_Feature)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Poly_A_site)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Promoter)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::TranscriptI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::UTR)
perl(Bio::SeqFeature::Generic)
perl(Bio::SeqFeature::PositionProxy)
perl(Bio::SeqFeature::Primer)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo)
perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Pair)
perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)
perl(Bio::SeqFeature::TypedSeqFeatureI)
perl(Bio::SeqFeatureI)
perl(Bio::SeqI)
perl(Bio::SeqIO)
perl(Bio::SeqIO::FTHelper)
perl(Bio::SeqIO::MultiFile)
perl(Bio::SeqIO::abi)
perl(Bio::SeqIO::ace)
perl(Bio::SeqIO::agave)
perl(Bio::SeqIO::alf)
perl(Bio::SeqIO::asciitree)
perl(Bio::SeqIO::bsml)
perl(Bio::SeqIO::bsml_sax)
perl(Bio::SeqIO::chadoxml)
perl(Bio::SeqIO::chaos)
perl(Bio::SeqIO::chaosxml)
perl(Bio::SeqIO::ctf)
perl(Bio::SeqIO::embl)
perl(Bio::SeqIO::entrezgene)
perl(Bio::SeqIO::excel)
perl(Bio::SeqIO::exp)
perl(Bio::SeqIO::fasta)
perl(Bio::SeqIO::fastq)
perl(Bio::SeqIO::game)
perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)
perl(Bio::SeqIO::game::gameSubs)
perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)
perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)
perl(Bio::SeqIO::gcg)
perl(Bio::SeqIO::genbank)
perl(Bio::SeqIO::interpro)
perl(Bio::SeqIO::kegg)
perl(Bio::SeqIO::largefasta)
perl(Bio::SeqIO::lasergene)
perl(Bio::SeqIO::locuslink)
perl(Bio::SeqIO::metafasta)
perl(Bio::SeqIO::phd)
perl(Bio::SeqIO::pir)
perl(Bio::SeqIO::pln)
perl(Bio::SeqIO::qual)
perl(Bio::SeqIO::raw)
perl(Bio::SeqIO::scf)
perl(Bio::SeqIO::strider)
perl(Bio::SeqIO::swiss)
perl(Bio::SeqIO::tab)
perl(Bio::SeqIO::table)
perl(Bio::SeqIO::tigr)
perl(Bio::SeqIO::tigrxml)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq)
perl(Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler)
perl(Bio::SeqIO::ztr)
perl(Bio::SeqUtils)
perl(Bio::SimpleAlign)
perl(Bio::SimpleAnalysisI)
perl(Bio::Species)
perl(Bio::Structure::Atom)
perl(Bio::Structure::Chain)
perl(Bio::Structure::Entry)
perl(Bio::Structure::IO)
perl(Bio::Structure::IO::pdb)
perl(Bio::Structure::Model)
perl(Bio::Structure::Residue)
perl(Bio::Structure::SecStr::DSSP::Res)
perl(Bio::Structure::SecStr::STRIDE::Res)
perl(Bio::Structure::StructureI)
perl(Bio::Symbol::Alphabet)
perl(Bio::Symbol::AlphabetI)
perl(Bio::Symbol::DNAAlphabet)
perl(Bio::Symbol::ProteinAlphabet)
perl(Bio::Symbol::Symbol)
perl(Bio::Symbol::SymbolI)
perl(Bio::Taxon)
perl(Bio::Taxonomy)
perl(Bio::Taxonomy::FactoryI)
perl(Bio::Taxonomy::Node)
perl(Bio::Taxonomy::Taxon)
perl(Bio::Taxonomy::Tree)
perl(Bio::Tools::AlignFactory)
perl(Bio::Tools::Alignment::Consed)
perl(Bio::Tools::Alignment::Trim)
perl(Bio::Tools::Analysis::DNA::ESEfinder)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Domcut)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::ELM)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::GOR4)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::HNN)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Mitoprot)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::NetPhos)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Scansite)
perl(Bio::Tools::Analysis::Protein::Sopma)
perl(Bio::Tools::Analysis::SimpleAnalysisBase)
perl(Bio::Tools::AnalysisResult)
perl(Bio::Tools::BPbl2seq)
perl(Bio::Tools::BPlite)
perl(Bio::Tools::BPlite::HSP)
perl(Bio::Tools::BPlite::Iteration)
perl(Bio::Tools::BPlite::Sbjct)
perl(Bio::Tools::BPpsilite)
perl(Bio::Tools::Blat)
perl(Bio::Tools::CodonTable)
perl(Bio::Tools::Coil)
perl(Bio::Tools::ECnumber)
perl(Bio::Tools::EMBOSS::Palindrome)
perl(Bio::Tools::EPCR)
perl(Bio::Tools::ERPIN)
perl(Bio::Tools::ESTScan)
perl(Bio::Tools::Eponine)
perl(Bio::Tools::Est2Genome)
perl(Bio::Tools::Fgenesh)
perl(Bio::Tools::FootPrinter)
perl(Bio::Tools::GFF)
perl(Bio::Tools::Gel)
perl(Bio::Tools::Geneid)
perl(Bio::Tools::Genemark)
perl(Bio::Tools::Genewise)
perl(Bio::Tools::Genomewise)
perl(Bio::Tools::Genscan)
perl(Bio::Tools::Glimmer)
perl(Bio::Tools::Grail)
perl(Bio::Tools::GuessSeqFormat)
perl(Bio::Tools::HMM)
perl(Bio::Tools::HMMER::Domain)
perl(Bio::Tools::HMMER::Results)
perl(Bio::Tools::HMMER::Set)
perl(Bio::Tools::Hmmpfam)
perl(Bio::Tools::IUPAC)
perl(Bio::Tools::Lucy)
perl(Bio::Tools::MZEF)
perl(Bio::Tools::OddCodes)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy)
perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::ModelResult)
perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::Result)
perl(Bio::Tools::Phylo::Phylip::ProtDist)
perl(Bio::Tools::Prediction::Exon)
perl(Bio::Tools::Prediction::Gene)
perl(Bio::Tools::Primer3)
perl(Bio::Tools::Primer::Assessor::Base)
perl(Bio::Tools::Primer::AssessorI)
perl(Bio::Tools::Primer::Feature)
perl(Bio::Tools::Primer::Pair)
perl(Bio::Tools::Prints)
perl(Bio::Tools::Profile)
perl(Bio::Tools::Promoterwise)
perl(Bio::Tools::PrositeScan)
perl(Bio::Tools::Pseudowise)
perl(Bio::Tools::QRNA)
perl(Bio::Tools::RNAMotif)
perl(Bio::Tools::RandomDistFunctions)
perl(Bio::Tools::RepeatMasker)
perl(Bio::Tools::RestrictionEnzyme)
perl(Bio::Tools::Run::GenericParameters)
perl(Bio::Tools::Run::ParametersI)
perl(Bio::Tools::Run::RemoteBlast)
perl(Bio::Tools::Run::StandAloneBlast)
perl(Bio::Tools::Run::WrapperBase)
perl(Bio::Tools::Seg)
perl(Bio::Tools::SeqPattern)
perl(Bio::Tools::SeqStats)
perl(Bio::Tools::SeqWords)
perl(Bio::Tools::SiRNA)
perl(Bio::Tools::SiRNA::Ruleset::saigo)
perl(Bio::Tools::SiRNA::Ruleset::tuschl)
perl(Bio::Tools::Sigcleave)
perl(Bio::Tools::Signalp)
perl(Bio::Tools::Sim4::Exon)
perl(Bio::Tools::Sim4::Results)
perl(Bio::Tools::Spidey::Exon)
perl(Bio::Tools::Spidey::Results)
perl(Bio::Tools::Tmhmm)
perl(Bio::Tools::dpAlign)
perl(Bio::Tools::ipcress)
perl(Bio::Tools::isPcr)
perl(Bio::Tools::pICalculator)
perl(Bio::Tools::pSW)
perl(Bio::Tools::tRNAscanSE)
perl(Bio::Tree::AlleleNode)
perl(Bio::Tree::Compatible)
perl(Bio::Tree::DistanceFactory)
perl(Bio::Tree::Draw::Cladogram)
perl(Bio::Tree::Node)
perl(Bio::Tree::NodeI)
perl(Bio::Tree::NodeNHX)
perl(Bio::Tree::RandomFactory)
perl(Bio::Tree::Statistics)
perl(Bio::Tree::Tree)
perl(Bio::Tree::TreeFunctionsI)
perl(Bio::Tree::TreeI)
perl(Bio::TreeIO)
perl(Bio::TreeIO::TreeEventBuilder)
perl(Bio::TreeIO::cluster)
perl(Bio::TreeIO::lintree)
perl(Bio::TreeIO::newick)
perl(Bio::TreeIO::nexus)
perl(Bio::TreeIO::nhx)
perl(Bio::TreeIO::pag)
perl(Bio::TreeIO::svggraph)
perl(Bio::TreeIO::tabtree)
perl(Bio::UpdateableSeqI)
perl(Bio::Variation::AAChange)
perl(Bio::Variation::AAReverseMutate)
perl(Bio::Variation::Allele)
perl(Bio::Variation::DNAMutation)
perl(Bio::Variation::IO)
perl(Bio::Variation::IO::flat)
perl(Bio::Variation::IO::xml)
perl(Bio::Variation::RNAChange)
perl(Bio::Variation::SNP)
perl(Bio::Variation::SeqDiff)
perl(Bio::Variation::VariantI)
perl(Bio::WebAgent)
perl(FeatureStore)
perl(TestInterface)
perl(TestObject)
perl-bioperl

Requires :

perl(Bio::Variation::DNAMutation)

perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::ModelResult)

perl(Bio::CodonUsage::Table)

perl(Bio::Annotation::TypeManager)

perl(Bio::Graphics::Glyph::segments)

perl(Text::Wrap)

perl(Bio::Tools::BPlite::HSP)

perl(Bio::Seq::RichSeq)

perl(Bio::Expression::Sample)

perl(Bio::Search::GenericStatistics)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlcmap)

perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)

perl(Bio::Seq::Quality)

perl(Bio::Biblio::MedlineBook)

perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)

perl(Convert::Binary::C)

perl(Bio::AnnotatableI)

perl(Bio::DB::GFF::Aggregator)

perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result)

perl(Bio::Factory::ObjectFactoryI)

perl(File::Temp)

perl(Symbol)

perl(Bio::SeqIO::game::seqHandler)

perl(Bio::Ontology::TermFactory)

perl(Bio::Root::Root)

perl(Bio::Annotation::DBLink)

perl(Bio::Cluster::ClusterFactory)

perl(Env)

perl(Bio::Annotation::OntologyTerm)

perl(Bio::Map::SimpleMap)

perl(Bio::FeatureIO)

perl(:MODULE_COMPAT_5.8.8)

perl(Storable)

perl(Pod::Usage)

perl(Bio::DB::GFF::RelSegment)

perl(Bio::Restriction::Enzyme)

perl(Bio::Coordinate::Pair)

perl(Bio::Search::BlastStatistics)

perl(Bio::Root::HTTPget)

perl(Bio::Tools::Spidey::Exon)

perl(Bio::Structure::Residue)

perl(Bio::Seq::Meta::Array)

perl(Bio::CodonUsage::IO)

perl(Bio::DB::GFF::Util::Binning)

perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)

perl(Bio::Restriction::IO)

perl(IO::Pipe)

perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)

perl(Bio::TreeIO::TreeEventBuilder)

perl(Bio::SeqIO::MultiFile)

perl(Bio::DB::GFF::Typename)

perl(HTML::Entities)

perl(Bio::SeqFeature::Primer)

perl(Bio::DB::RandomAccessI)

perl(XML::Writer)

perl(SVG) => 2.26

perl(Bio::Coordinate::Collection)

perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)

perl(Bio::SeqFeature::Generic)

perl(Data::Dumper)

perl(Bio::Assembly::Scaffold)

perl(Bio::AlignIO)

perl(Bio::Tree::Compatible)

perl(Bio::Map::Contig)

perl(Bio::Location::Simple)

perl => 0:5.005_62

perl(Bio::Matrix::PSM::Psm)

perl(Bio::SeqFeature::Tools::TypeMapper)

perl(Bio::WebAgent)

perl(Bio::Matrix::Scoring)

perl(Bio::SeqFeature::Tools::Unflattener)

perl(Bio::Phenotype::OMIM::MiniMIMentry)

perl(Bio::SearchIO)

perl(Bio::Phenotype::MeSH::Twig)

perl(Bio::Tools::Prediction::Gene)

perl(Bio::DB::BioFetch)

perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)

perl(Graph::Directed)

perl(Bio::Assembly::Singlet)

perl(XML::Parser::PerlSAX)

perl(DB_File)

perl(Bio::Ontology::OntologyStore)

perl(Bio::Location::Atomic)

perl(Bio::Seq::PrimaryQual)

perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)

perl(Bio::Biblio::MedlineJournal)

perl(Cwd)

perl(Bio::Tools::IUPAC)

perl(Bio::DB::Registry)

perl(Bio::SeqUtils)

perl(Bio::Matrix::PSM::InstanceSite)

perl(Bio::Graph::ProteinGraph)

perl(Scalar::Util)

perl(Bio::Tools::Genewise)

perl(Bio::Map::CytoPosition)

perl(Bio::Variation::VariantI)

perl(Bio::SeqIO::bsml)

perl(IO::File)

perl(Bio::Tree::TreeI)

perl(Bio::PopGen::Genotype)

perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentryAllelicVariant)

perl(Bio::DB::SeqFeature::Segment)

perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)

perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Pair)

perl(Bio::Ontology::OBOEngine)

perl(Getopt::Long)

perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Unit)

perl(Bio::PrimarySeq)

perl(Bio::Factory::ObjectFactory)

perl(Bio::Tools::AnalysisResult)

perl(Bio::LiveSeq::Transcript)

perl(XML::Handler::Subs)

perl(English)

perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)

perl(Bio::Search::HSP::HmmpfamHSP)

perl(Bio::Graph::SimpleGraph)

perl(Bio::PrimarySeqI)

perl(Bio::Species)

perl(Bio::SeqIO::gcg)

perl(XML::Parser)

perl(Carp)

perl(LWP)

perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtDist)

perl(Bio::SeqIO::game::gameWriter)

perl(Tie::RefHash)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::caching_handle)

perl(Bio::LocationI)

perl(Bio::SeqFeature::Annotated)

perl(Bio::Range)

perl(Bio::Map::Physical)

perl(Bio::Tools::BPpsilite)

perl(Bio::Structure::Model)

perl(Bio::DB::SeqFeature)

perl(GD)

perl(Bio::Cluster::SequenceFamily)

perl(Fcntl)

perl(overload)

perl(XML::SAX)

perl(Math::Trig)

perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)

perl(Bio::Tree::Node)

perl(Bio::PopGen::IO)

perl(File::Path)

perl(Bio::Tools::BPlite)

perl(Bio::Tools::Phylo::PAML::Result)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::pg)

perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)

perl(Bio::Search::Result::HmmpfamResult)

perl(Bio::Coordinate::ExtrapolatingPair)

perl(Bio::Tree::NodeNHX)

perl(Bio::Tools::Sim4::Exon)

perl(Bio::Biblio::IO)

perl(HTTP::Request::Common)

perl(Bio::Annotation::Collection)

perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)

perl(Bio::DB::SeqFeature::Store::DBI::Iterator)

perl(Bio::Taxonomy::Taxon)

perl(Bio::Tools::Alignment::Trim)

perl(HTML::HeadParser)

perl(Bio::Assembly::IO)

/usr/bin/perl

perl(Bio::Tools::Prediction::Exon)

perl(Bio::DB::Taxonomy)

perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)

perl(Bio::Graphics::Feature)

perl(Bio::Tools::Run::Alignment::Clustalw)

perl(Bio::LiveSeq::Intron)

perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry)

perl(Bio::LiveSeq::Chain)

perl(Bio::DB::RefSeq)

perl(Bio::Structure::Atom)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory::iterator)

perl(Bio::Ontology::RelationshipType)

perl(Bio::Search::SearchUtils)

perl(Bio::Tree::AlleleNode)

perl(Bio::Seq::SeqFactory)

perl(Bio::Variation::SNP)

perl(Bio::SeqFeatureI)

perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo)

perl(URI::Escape)

perl(Getopt::Std)

perl(Bio::DB::Failover)

perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::Neighbor)

perl(Bio::SeqIO::FTHelper)

perl(Clone)

rpmlib(PayloadFilesHavePrefix) <= 4.0-1

perl(Bio::Variation::SeqDiff)

perl(File::Basename)

perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)

perl(Bio::PopGen::Simulation::Coalescent)

perl(Bio::Expression::Contact)

perl(Bio::Tools::BPlite::Sbjct)

perl(Bio::Annotation::SimpleValue)

perl(Bio::Tools::GuessSeqFormat)

perl(Bio::Annotation::Comment)

perl(strict)

perl(Bio::Graphics::Panel)

perl(Text::Balanced)

perl(POSIX)

perl(File::Spec)

perl(Digest::MD5)

perl(Exporter)

perl(CGI)

perl(Bio::PopGen::Statistics)

perl(Bio::Expression::DataSet)

perl(Bio::Graphics::FeatureFile)

perl(Bio::SeqFeature::Similarity)

perl(Bio::Tools::HMMER::Domain)

perl(Bio::Tools::BPlite::Iteration)

perl(XML::DOM::XPath)

perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)

perl(Bio::LiveSeq::DNA)

perl(Bio::Location::Split)

perl(Bio::Variation::AAChange)

perl(LWP::UserAgent)

perl(Bio::Coordinate::Graph)

perl(Bio::DB::GFF::Util::Rearrange)

perl(Bio::Ontology::Term)

perl(Bio::Matrix::PhylipDist)

perl(Bio::Event::EventGeneratorI)

perl(SOAP::Lite)

perl(Bio::Root::Version)

perl(Ace)

perl(Bio::ASN1::EntrezGene)

perl(Bio::Ontology::RelationshipFactory)

perl(Bio::SeqFeature::Gene::Transcript)

perl(XML::Simple)

perl(Bio::Matrix::PSM::ProtMatrix)

perl(integer)

perl(Bio::Align::Utilities)

perl(Bio::Graphics)

perl(Bio::Tools::BPbl2seq)

perl => 0:5.006_001

perl(Bio::LiveSeq::AARange)

perl(FileHandle)

perl(Bio::Variation::Allele)

perl(Bio::Structure::Chain)

perl(Bio::Align::DNAStatistics)

perl(Bio::Ontology::TermI)

perl(Tree::DAG_Node)

perl(Bio::Annotation::Target)

perl(Bio::LiveSeq::Prim_Transcript)

perl(base)

perl(Bio::Das::SegmentI)

perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Region)

perl(Bio::Search::Hit::HmmpfamHit)

perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)

perl(Bio::Root::IO)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysqlopt)

perl(Bio::DB::GenBank)

perl(Bio::Expression::Platform)

perl(Bio::DB::GFF)

perl(Bio::Tools::Run::RemoteBlast)

perl(Bio::Seq::Meta)

perl(Bio::DB::EMBL)

perl(SVG::Graph::Data::Node)

perl(Bio::DB::GFF::Feature)

perl(Bio::Biblio::Person)

perl(Bio::DB::GFF::Featname)

perl(Data::Stag::XMLWriter)

perl(Bio::Search::HSP::HSPFactory)

perl(Bio::Tools::GFF)

perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)

perl(Bio::Tools::Run::GenericParameters)

perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiSite)

perl(Bio::Phenotype::Measure)

perl(Bio::DB::Query::GenBank)

perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::mysql)

perl(Bio::Map::Position)

perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor02)

perl(XML::Twig)

perl(Bio::SimpleAlign)

perl(Spreadsheet::ParseExcel)

perl(Bio::PopGen::Marker)

perl(Bio::Graphics::Glyph::Factory)

perl(HTML::Parser)

perl(File::Spec::Functions)

perl(Bio::Ontology::Relationship)

perl(List::Util)

perl(Bio::Annotation::AnnotationFactory)

perl => 0:5.006

perl(Bio::Seq::QualI)

perl(Bio::OntologyIO)

perl(Bio::PopGen::Population)

perl(IO::Socket)

perl(Bio::Annotation::StructuredValue)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::memory::feature_serializer)

perl(Memoize)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::berkeleydb::iterator)

perl(Bio::Map::Mappable)

perl(Bio::Ontology::DocumentRegistry)

perl(Bio::Restriction::EnzymeCollection)

perl(DBI)

perl(SVG::Graph::Data)

perl(Bio::Coordinate::Result::Gap)

perl(Bio::Biblio::Provider)

perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Phylip::ProtPars)

perl(Bio::Biblio)

perl(PostScript::TextBlock)

perl(Bio::Restriction::Enzyme::MultiCut)

perl(Text::ParseWords)

perl(Bio::Seq::SeqBuilder)

perl(Bio::SeqFeature::Collection)

perl(SVG::Graph::Data::Tree)

perl(Bio::Tools::HMMER::Set)

perl(Bio::Tools::Genomewise)

perl(Error)

perl(Bio::LiveSeq::SeqI)

perl(Bio::Phenotype::Correlate)

perl(Bio::Assembly::Contig)

perl(warnings)

perl(IO::Handle)

perl(Bio::Search::BlastUtils)

perl(constant)

perl(Bio::Biblio::Organisation)

perl(Bio::Tools::Run::Phylo::Molphy::ProtML)

perl(Bio::Seq)

perl(Bio::DB::GFF::Homol)

perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)

perl(LWP::Simple)

perl(Bio::Symbol::Symbol)

perl(Bio::Annotation::Reference)

perl(Bio::DB::Fasta)

perl(Bio::Coordinate::Result)

perl(Bio::Root::RootI)

perl(Bio::Tree::Tree)

perl(lib)

perl(XML::Writer) => 0.4

perl(URI)

perl(Bio::Cluster::UniGene)

perl(Bio::Structure::Entry)

rpmlib(CompressedFileNames) <= 3.0.4-1

perl(SVG::Graph)

perl(Bio::Matrix::PSM::IO)

perl(Bio::SeqIO::game::gameHandler)

perl(IO::String)

perl(Bio::RangeI)

perl(Dumpvalue)

perl(Bio::TreeIO)

perl(Bio::Tools::SeqStats)

perl(Data::Stag)

perl(Bio::Coordinate::Result::Match)

perl(Bio::Symbol::Alphabet)

perl(Bio::SeqIO)

perl(vars)

perl(Bio::SeqFeature::Tools::IDHandler)

perl(Bio::Map::PositionHandler)

perl(Bio::Phenotype::MeSH::Term)

perl(UNIVERSAL)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi)

perl(Bio::Map::LinkagePosition)

perl(HTTP::Response)

perl(Bio::Taxon)

perl(Bio::Graphics::Util)

perl(WWW::Mechanize)

perl(Math::BigFloat)

perl(Cache::FileCache)

perl(Bio::Seq::PrimedSeq)

perl(Bio::LiveSeq::Mutation)

perl(AnyDBM_File)

perl(XML::DOM)

perl(Time::Local)

perl(Bio::LiveSeq::Exon)

perl(Set::Scalar)

perl(Bio::LiveSeq::Gene)

perl(Bio::DB::Flat)

perl(Bio::Ontology::Ontology)

perl(XML::SAX::Writer)

perl(Bio::PopGen::Individual)

perl(Bio::Location::Fuzzy)

perl(Bio::LocatableSeq)

perl(Bio::Factory::FTLocationFactory)

perl(Bio::DB::SeqFeature::Store)

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perl(Bio::DB::EUtilities::Cookie)

perl(Bio::Tools::RandomDistFunctions)

perl(Bio::Tools::CodonTable)

perl(Bio::DB::EUtilities::ElinkData)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::biofetch)

perl(Bio::Map::FPCMarker)

rpmlib(VersionedDependencies) <= 3.0.3-1

perl(Bio::Map::Clone)

perl(Bio::DB::GFF::Adaptor::dbi::iterator)

perl(CGI::Carp)

perl(Bio::Seq::SequenceTrace)

perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)

perl(Bio::SeqIO::tinyseq::tinyseqHandler)

perl(Bio::AnnotationI)

perl(Bio::DB::SwissProt)

perl(Bio::Graph::Edge)

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perl(Bio::Variation::RNAChange)

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Content of RPM :
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