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perl-bioperl rpm build for : Mandriva 2010. For other distributions click perl-bioperl.

Name : perl-bioperl
Version : 1.6.1 Vendor : Mandriva
Release : 1mdv2010.0 Date : 2009-09-30 17:28:32
Group : Development/Perl Source RPM : perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.src.rpm
Size : 14.72 MB
Packager : Jérôme Quelin < jquelin_mandriva_org>
Summary : BioPerl core modules
Description :
Officially organized in 1995 and existing informally for several years
prior, The Bioperl Project is an international association of developers
of open source Perl tools for bioinformatics, genomics and life science
research.

RPM found in directory: /mirror/carroll.cac.psu.edu/pub/linux/distributions/mandrakelinux/official/2010.1/i586/media/contrib/release

Content of RPM  Changelog  Provides Requires

Download
ftp.uni-bayreuth.de  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
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ftp.gwdg.de  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.uni-bayreuth.de  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.gwdg.de  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
bo.mirror.garr.it  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
bo.mirror.garr.it  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
bo.mirror.garr.it  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
bo.mirror.garr.it  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.icm.edu.pl  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.pbone.net  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.pbone.net  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.isu.edu.tw  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.isu.edu.tw  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.isu.edu.tw  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
ftp.isu.edu.tw  perl-bioperl-1.6.1-1mdv2010.0.noarch.rpm
     

Provides :
perl-Bioperl
perl(Bio::Align::AlignI)
perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Align::PairwiseStatistics)
perl(Bio::Align::ProteinStatistics)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::Align::Utilities)
perl(Bio::AlignIO)
perl(Bio::AlignIO::Handler::GenericAlignHandler)
perl(Bio::AlignIO::arp)
perl(Bio::AlignIO::bl2seq)
perl(Bio::AlignIO::clustalw)
perl(Bio::AlignIO::emboss)
perl(Bio::AlignIO::fasta)
perl(Bio::AlignIO::largemultifasta)
perl(Bio::AlignIO::maf)
perl(Bio::AlignIO::mase)
perl(Bio::AlignIO::mega)
perl(Bio::AlignIO::meme)
perl(Bio::AlignIO::metafasta)
perl(Bio::AlignIO::msf)
perl(Bio::AlignIO::nexus)
perl(Bio::AlignIO::pfam)
perl(Bio::AlignIO::phylip)
perl(Bio::AlignIO::po)
perl(Bio::AlignIO::proda)
perl(Bio::AlignIO::prodom)
perl(Bio::AlignIO::psi)
perl(Bio::AlignIO::selex)
perl(Bio::AlignIO::stockholm)
perl(Bio::AlignIO::xmfa)
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perl(Bio::AnalysisI::JobI)
perl(Bio::AnalysisParserI)
perl(Bio::AnalysisResultI)
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perl(Bio::Annotation::Collection)
perl(Bio::Annotation::Comment)
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perl(Bio::Annotation::Target)
perl(Bio::Annotation::Tree)
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perl(Bio::Biblio::BookArticle)
perl(Bio::Biblio::IO)
perl(Bio::Biblio::IO::medline2ref)
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perl(Bio::Biblio::IO::pubmedxml)
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perl(Bio::Biblio::MedlineBook)
perl(Bio::Biblio::MedlineBookArticle)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournal)
perl(Bio::Biblio::MedlineJournalArticle)
perl(Bio::Biblio::Organisation)
perl(Bio::Biblio::Patent)
perl(Bio::Biblio::Person)
perl(Bio::Biblio::Proceeding)
perl(Bio::Biblio::Provider)
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perl(Bio::Biblio::PubmedBookArticle)
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perl(Bio::Coordinate::ResultI)
perl(Bio::Coordinate::Utils)
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perl(Bio::DB::DBFetch)
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perl(Bio::Expression::DataSet)
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perl(Bio::Factory::ObjectFactory)
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perl(Bio::Factory::SequenceProcessorI)
perl(Bio::Factory::SequenceStreamI)
perl(Bio::Factory::TreeFactoryI)
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perl(Bio::FeatureIO)
perl(Bio::FeatureIO::bed)
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perl(Bio::FeatureIO::vecscreen_simple)
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perl(Bio::LiveSeq::DNA)
perl(Bio::LiveSeq::Exon)
perl(Bio::LiveSeq::Gene)
perl(Bio::LiveSeq::IO::BioPerl)
perl(Bio::LiveSeq::IO::Loader)
perl(Bio::LiveSeq::Intron)
perl(Bio::LiveSeq::Mutation)
perl(Bio::LiveSeq::Mutator)
perl(Bio::LiveSeq::Prim_Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Range)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Region)
perl(Bio::LiveSeq::Repeat_Unit)
perl(Bio::LiveSeq::SeqI)
perl(Bio::LiveSeq::Transcript)
perl(Bio::LiveSeq::Translation)
perl(Bio::LocatableSeq)
perl(Bio::Location::Atomic)
perl(Bio::Location::AvWithinCoordPolicy)
perl(Bio::Location::CoordinatePolicyI)
perl(Bio::Location::Fuzzy)
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perl(Bio::Location::NarrowestCoordPolicy)
perl(Bio::Location::Simple)
perl(Bio::Location::Split)
perl(Bio::Location::SplitLocationI)
perl(Bio::Location::WidestCoordPolicy)
perl(Bio::LocationI)
perl(Bio::Map::Clone)
perl(Bio::Map::Contig)
perl(Bio::Map::CytoMap)
perl(Bio::Map::CytoMarker)
perl(Bio::Map::CytoPosition)
perl(Bio::Map::EntityI)
perl(Bio::Map::FPCMarker)
perl(Bio::Map::Gene)
perl(Bio::Map::GeneMap)
perl(Bio::Map::GenePosition)
perl(Bio::Map::GeneRelative)
perl(Bio::Map::LinkageMap)
perl(Bio::Map::LinkagePosition)
perl(Bio::Map::MapI)
perl(Bio::Map::Mappable)
perl(Bio::Map::MappableI)
perl(Bio::Map::Marker)
perl(Bio::Map::MarkerI)
perl(Bio::Map::Microsatellite)
perl(Bio::Map::OrderedPosition)
perl(Bio::Map::OrderedPositionWithDistance)
perl(Bio::Map::Physical)
perl(Bio::Map::Position)
perl(Bio::Map::PositionHandler)
perl(Bio::Map::PositionHandlerI)
perl(Bio::Map::PositionI)
perl(Bio::Map::PositionWithSequence)
perl(Bio::Map::Prediction)
perl(Bio::Map::Relative)
perl(Bio::Map::RelativeI)
perl(Bio::Map::SimpleMap)
perl(Bio::Map::TranscriptionFactor)
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perl(Bio::Matrix::IO::phylip)
perl(Bio::Matrix::IO::scoring)
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perl(Bio::Matrix::Mlagan)
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perl(Bio::Matrix::PSM::IO::mast)
perl(Bio::Matrix::PSM::IO::masta)
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perl(Bio::Ontology::Path)
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perl(Bio::Ontology::RelationshipType)
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perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
perl(Bio::Ontology::Term)
perl(Bio::Ontology::TermFactory)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Bio::OntologyIO)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::BaseSAXHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterProHandler)
perl(Bio::OntologyIO::Handlers::InterPro_BioSQL_Handler)
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perl(Bio::Phenotype::OMIM::OMIMentry)
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perl(Bio::PhyloNetwork::TreeFactoryX)
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perl(Bio::Root::Storable)
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perl(Bio::Search::HSP::PsiBlastHSP)
perl(Bio::Search::HSP::PullHSPI)
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perl(Bio::Search::Hit::BlastPullHit)
perl(Bio::Search::Hit::Fasta)
perl(Bio::Search::Hit::GenericHit)
perl(Bio::Search::Hit::HMMERHit)
perl(Bio::Search::Hit::HitFactory)
perl(Bio::Search::Hit::HitI)
perl(Bio::Search::Hit::HmmpfamHit)
perl(Bio::Search::Hit::ModelHit)
perl(Bio::Search::Hit::PsiBlastHit)
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perl(Bio::Search::Iteration::IterationI)
perl(Bio::Search::Processor)
perl(Bio::Search::Result::BlastPullResult)
perl(Bio::Search::Result::BlastResult)
perl(Bio::Search::Result::CrossMatchResult)
perl(Bio::Search::Result::GenericResult)
perl(Bio::Search::Result::HMMERResult)
perl(Bio::Search::Result::HmmpfamResult)
perl(Bio::Search::Result::PullResultI)
perl(Bio::Search::Result::ResultFactory)
perl(Bio::Search::Result::ResultI)
perl(Bio::Search::Result::WABAResult)
perl(Bio::Search::SearchUtils)
perl(Bio::Search::StatisticsI)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTileUtils)
perl(Bio::Search::Tiling::MapTiling)
perl(Bio::Search::Tiling::TilingI)
perl(Bio::SearchDist)
perl(Bio::SearchIO)
perl(Bio::SearchIO::EventHandlerI)
perl(Bio::SearchIO::FastHitEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::IteratedSearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchResultEventBuilder)
perl(Bio::SearchIO::SearchWriterI)
perl(Bio::SearchIO::Writer::BSMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::GbrowseGFF)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HSPTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HTMLResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::HitTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::ResultTableWriter)
perl(Bio::SearchIO::Writer::TextResultWriter)
perl(Bio::SearchIO::XML::BlastHandler)
perl(Bio::SearchIO::XML::PsiBlastHandler)
perl(Bio::SearchIO::axt)
perl(Bio::SearchIO::blast)
perl(Bio::SearchIO::blast_pull)
perl(Bio::SearchIO::blasttable)
perl(Bio::SearchIO::blastxml)
perl(Bio::SearchIO::cross_match)
perl(Bio::SearchIO::erpin)
perl(Bio::SearchIO::exonerate)
perl(Bio::SearchIO::fasta)
perl(Bio::SearchIO::gmap_f9)
perl(Bio::SearchIO::hmmer)
perl(Bio::SearchIO::hmmer_pull)
perl(Bio::SearchIO::infernal)
perl(Bio::SearchIO::megablast)
perl(Bio::SearchIO::psl)
perl(Bio::SearchIO::rnamotif)
perl(Bio::SearchIO::sim4)
perl(Bio::SearchIO::waba)
perl(Bio::SearchIO::wise)
perl(Bio::Seq)
perl(Bio::Seq::BaseSeqProcessor)
perl(Bio::Seq::EncodedSeq)
perl(Bio::Seq::LargeLocatableSeq)
perl(Bio::Seq::LargePrimarySeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeq)
perl(Bio::Seq::LargeSeqI)
perl(Bio::Seq::Meta)
perl(Bio::Seq::Meta::Array)
perl(Bio::Seq::MetaI)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual)
perl(Bio::Seq::PrimaryQual::Qual)
perl(Bio::Seq::PrimedSeq)
perl(Bio::Seq::QualI)
perl(Bio::Seq::Quality)
perl(Bio::Seq::RichSeq)
perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(Bio::Seq::SeqBuilder)
perl(Bio::Seq::SeqFactory)
perl(Bio::Seq::SeqFastaSpeedFactory)
perl(Bio::Seq::SeqWithQuality)
perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
perl(Bio::Seq::TraceI)
perl(Bio::SeqAnalysisParserI)
perl(Bio::SeqEvolution::DNAPoint)
perl(Bio::SeqEvolution::EvolutionI)
perl(Bio::SeqEvolution::Factory)
perl(Bio::SeqFeature::Annotated)
perl(Bio::SeqFeature::AnnotationAdaptor)
perl(Bio::SeqFeature::Collection)
perl(Bio::SeqFeature::CollectionI)
perl(Bio::SeqFeature::Computation)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::Exon)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::ExonI)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructure)
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perl(Bio::SeqFeature::Gene::Intron)
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perl(Bio::SeqFeature::SiRNA::Oligo)
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perl(Bio::SeqFeature::Similarity)
perl(Bio::SeqFeature::SimilarityPair)
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perl(Bio::SeqIO)
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perl(Bio::SeqIO::chaos)
perl(Bio::SeqIO::chaosxml)
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perl(Bio::SeqIO::embldriver)
perl(Bio::SeqIO::entrezgene)
perl(Bio::SeqIO::excel)
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perl(Bio::SeqIO::fastq)
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perl(Bio::SeqIO::swissdriver)
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perl(Q)
perl(QRY)
perl(R)
perl-bioperl

Requires :
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perl(Text::Wrap)
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perl(Bio::Tree::Node)
perl(Bio::PopGen::IO)
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perl(Bio::Biblio::Ref)
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perl(Bio::Tree::AlleleNode)
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perl(Text::Shellwords)
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perl(Bio::Tools::EUtilities::Summary::Item)
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rpmlib(PayloadFilesHavePrefix) <= 4.0-1
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perl(Bio::DB::Expression)
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perl(File::Glob)
perl(Bio::AnalysisResultI)
perl(File::Spec)
perl(Bio::Das::FeatureTypeI)
perl(CGI)
perl(Bio::Factory::ObjectBuilderI)
perl(Bio::Biblio::Journal)
perl(Bio::IdentifiableI)
perl(XML::DOM::XPath)
perl(Bio::SeqFeature::Tools::FeatureNamer)
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perl(Bio::Search::Tiling::MapTileUtils)
perl(Bio::Ontology::Term)
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perl(Bio::Root::Version)
perl(SOAP::Lite)
perl(Ace)
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perl(FileHandle)
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perl(Bio::Align::DNAStatistics)
perl(Bio::Annotation::TagTree)
perl(Bio::Location::FuzzyLocationI)
perl(Bio::Ontology::TermI)
perl(Tree::DAG_Node)
rpmlib(PayloadIsLzma) <= 4.4.6-1
perl(Bio::Search::Hit::HmmpfamHit)
perl(Bio::SeqFeature::Gene::GeneStructureI)
perl(Bio::SeqFeature::FeaturePair)
perl(Bio::Root::IO)
perl(Bio::FeatureHolderI)
perl(Bio::MolEvol::CodonModel)
perl(Bio::Expression::Platform)
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perl(Bio::Map::PositionHandlerI)
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perl(Bio::SeqIO::game::featHandler)
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perl(Bio::AnalysisParserI)
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perl(Bio::Ontology::SimpleGOEngine::GraphAdaptor02)
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perl(Bio::Biblio::MedlineBookArticle)
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perl(IO::Socket)
perl(Memoize)
perl(Bio::Ontology::DocumentRegistry)
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perl(Math::Random)
perl(Bio::Coordinate::Result::Gap)
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perl(Bio::Biblio)
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perl(Text::ParseWords)
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perl(Bio::Tools::HMMER::Set)
perl(Error)
perl(Bio::Assembly::Contig)
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perl(Bio::Biblio::Organisation)
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perl(Bio::Tree::Tree)
perl(Array::Compare)
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perl(SVG::Graph)
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perl(Bio::Map::LinkagePosition)
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perl(Bio::Event::EventHandlerI)
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perl(Class::AutoClass) => 1.01
perl(Bio::Cluster::UniGeneI)
perl(Bio::Biblio::IO::medlinexml)
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perl(Bio::LocatableSeq)
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perl(Bio::Map::FPCMarker)
perl(Bio::Matrix::MatrixI)
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perl(Bio::Seq::SequenceTrace)
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perl(Bio::CodonUsage::Table)
perl(Bio::Annotation::TypeManager)
perl(Bio::Seq::RichSeqI)
perl(GraphViz)
perl(Test::Exception)
perl(Bio::Align::StatisticsI)
perl(Bio::LiveSeq::Range)
perl(Bio::Ontology::SimpleOntologyEngine)
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perl(Bio::Biblio::MedlineBook)
perl(Test::Builder)
perl(Bio::AnnotatableI)
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perl(Bio::Tools::Phylo::Molphy::Result)
perl(File::Temp)
perl(Symbol)
perl(Bio::Annotation::DBLink)
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Content of RPM :
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